קבוצת הנוער של הפועל בית שאן הבטיחה את עלייתה לליגה הארצית. שני המשחקים שנותרו לקבוצה עד סוף העונה הם לפרוטוקול בלבד. קבוצת הנוער מודרכת על ידי מנהל המחלקה מיקי בן שבת יחד עם המאמן המנוסה והוותיק אליאס לוי אחיו של אלישע לוי. בצוות המקצועי גם מאמן השוערים, ראובן בניסטי, שעושה, לפי עדות רבים "עבודת קודש" איתם.
במשך 20 שנה, בקירוב, מחלקת הנוער לא רשמה הישג משמעותי, והיו לא מעט עונות שבהן היא דשדשה בתחתית הליגה. כיום, קבוצת הנוער ממוקמת במקום הראשון במחוז יזרעאל עם 25 ניצחונות והפסד אחד בלבד. הקבוצה מציגה יכולת מצוינת מתחילת העונה, אשר במהלכה הפגינו רוב שחקניה כושר משחק מעולה.
השבוע "טיילה" קבוצת הנוער וחזרה עם ניצחון מוחץ 5-1 במשחק חוץ מול טירת הכרמל, הממוקמת במקום השני בליגה. לבית שאן כבשו דוד פרץ (שלושער) טל דגן ודור מרדכי. הקבוצה מצטרפת לליגה ארצית שם ישחקו מול קבוצות ותיקות בליגה כמו הפועל עפולה, אסי גלבוע, טבריה מגדל העמק. מלך השערים הוא דוד פרץ שכבש כ- 35 שערים.
מטרתה העיקרית של המחלקה היא להכשיר שחקנים לקבוצה הבוגרת. כבר בשנה הבאה צפויים להשתלב חמישה שחקנים מקבוצה בו בקבוצה הבוגרת.